Os catamarãs da linha de Morro de São Paulo também operam sem restrições, o mesmo acontecendo com as escunas de turismo que fazem o tour pelas ilhas da Baía de Todos os Santos. Os primeiros catamarãs para o Morro saem às 8h30 e 9h. Depois, os usuários encontram horários saindo do Terminal Náutico às 10h30, 13h e 14h30.
A previsão é de que todos os horários os catamarãs tenham lotação completa, com muitos turistas se deslocando para o final de semana na Ilha de Tinharé. As saídas de Morro de São Paulo ocorrem às 9h, 11h30, 13h e 15h. A viagem para o Morro dura em média 2h20. Para os turistas que vão fazer o passeio pelas ilhas, as escunas zarpam do terminal a partir das 9h e fazem duas paradas – a primeira em Ilha dos Frades e a segunda em Itaparica, de onde retornam às 17h30 para Salvador.